技術(shù)文獻(xiàn)
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環(huán)孢子蟲探針?lè)晒舛縋CR(qPCR)的核心原理基于?TaqMan探針技術(shù)?,通過(guò)熒光信號(hào)的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)實(shí)現(xiàn)目標(biāo)DNA的定量分析。其具體機(jī)制如下:
?探針設(shè)計(jì)?
探針為一段與環(huán)孢子蟲目標(biāo)序列互補(bǔ)的寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記?熒光報(bào)告基團(tuán)(如FAM)?和?淬滅基團(tuán)(如TAMRA)?。當(dāng)探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)的
熒光被淬滅基團(tuán)吸收,無(wú)信號(hào)輸出?。
?PCR擴(kuò)增與探針降解?
?退火階段?:探針與目標(biāo)DNA結(jié)合,形成雜交雙鏈。
?延伸階段?:Taq酶的5'→3'外切酶活性切割探針,釋放報(bào)告基團(tuán),熒光信號(hào)被檢測(cè)系統(tǒng)捕獲?。
?信號(hào)累積?:每擴(kuò)增一條DNA鏈,對(duì)應(yīng)一個(gè)熒光分子釋放,信號(hào)強(qiáng)度與目標(biāo)DNA量呈正比?。
?定量分析?
通過(guò)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)達(dá)到閾值(Ct值)所需的循環(huán)數(shù),結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算初始模板濃度?。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
?高特異性?:探針僅與目標(biāo)序列結(jié)合,避免非特異性擴(kuò)增干擾?。
?高靈敏度?:可檢測(cè)低至100拷貝的模板?。
?封閉反應(yīng)?:無(wú)需開(kāi)蓋操作,減少污染風(fēng)險(xiǎn)?。
與染料法的區(qū)別
探針?lè)ㄍㄟ^(guò)特異性探針識(shí)別目標(biāo)序列,而染料法(如SYBR Green)僅結(jié)合所有雙鏈DNA,特異性較低但成本更低?。
?探針設(shè)計(jì)?
探針為一段與環(huán)孢子蟲目標(biāo)序列互補(bǔ)的寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記?熒光報(bào)告基團(tuán)(如FAM)?和?淬滅基團(tuán)(如TAMRA)?。當(dāng)探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)的
熒光被淬滅基團(tuán)吸收,無(wú)信號(hào)輸出?。
?PCR擴(kuò)增與探針降解?
?退火階段?:探針與目標(biāo)DNA結(jié)合,形成雜交雙鏈。
?延伸階段?:Taq酶的5'→3'外切酶活性切割探針,釋放報(bào)告基團(tuán),熒光信號(hào)被檢測(cè)系統(tǒng)捕獲?。
?信號(hào)累積?:每擴(kuò)增一條DNA鏈,對(duì)應(yīng)一個(gè)熒光分子釋放,信號(hào)強(qiáng)度與目標(biāo)DNA量呈正比?。
?定量分析?
通過(guò)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)達(dá)到閾值(Ct值)所需的循環(huán)數(shù),結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算初始模板濃度?。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
?高特異性?:探針僅與目標(biāo)序列結(jié)合,避免非特異性擴(kuò)增干擾?。
?高靈敏度?:可檢測(cè)低至100拷貝的模板?。
?封閉反應(yīng)?:無(wú)需開(kāi)蓋操作,減少污染風(fēng)險(xiǎn)?。
與染料法的區(qū)別
探針?lè)ㄍㄟ^(guò)特異性探針識(shí)別目標(biāo)序列,而染料法(如SYBR Green)僅結(jié)合所有雙鏈DNA,特異性較低但成本更低?。